В панели "Утилиты" можно проверить структуру файловой системы загрузочного диска.
Внимание: Во время выполнения проверки OnyX временно заблокирует загрузочный том. Появится курсор ожидания (цветной волчок), и ваш компьютер будет выглядеть "зависшим". Всё в порядке, это очень продолжительная операция (от нескольких минут до нескольких часов), поэтому дождитесь результата.
It is possible to speed up the verification by deleting the Time Machine local snapshots beforehand.